两校区维修改造项目的实施是基建处的重点工作之一。在项目实施的前一年，配合国资处完成基建类专项项目征集、改造方案拟定、费用测算等申报工作；再根据每年下达的改善办学条件专项任务完成项目的施工图设计、招投标工作及施工工作。

2022年实施了明故宫东华湖环境整治、航空航天教育教学实践基地、B17栋公寓、后勤辅助用房，将军路校区材料科学与技术学院楼、艺术中心、6号教学楼、主体育场，两校区水表及阀门更换、电梯改造等41项维修改造项目。

2023年实施了明故宫MB05青年教工公寓修缮、四方新村八村博士后公寓、B8栋学生公寓，将军路校区博园6栋、怡园19栋、材料科学与技术学院楼（二期），两校区变电所设备及水电运行安全改造、学生公寓部分淋浴间改造等31项维修改造项目。

2024年实施了明故宫A15号楼、人环机实验室、A12号楼报告厅、明故宫校区立德树人馆加装电梯，将军路校学工楼、经济与管理学院、怡园20栋公寓楼、1号主楼1-4层等50余项维修改造项目。